Comenzó originalmente con 21 alumnas en preescolar y las salas del jardín de infantes y, 13 años después, su primera promoción egresó en el año 1993 con 29 chicas.

En febrero de 1988 el Colegio se trasladó a un nuevo predio en su actual ubicación. En Marzo de ese mismo año comenzaron las clases en el edificio nuevo y ese día el Obispo de San Isidro, Monseñor Jorge Cassaretto celebró Misa y bendijo las instalaciones y a la comunidad para que la gracia de Dios se derramara sobre la congregación cristiana del Holy Cross, que empezaba una nueva etapa.

Posteriormente el Colegio se constituyó como una fundación (Fundación Fernando Moreno) con el fin de dar continuidad a la obra educativa.

Luego se abrió el colegio de varones, con el objeto de ofrecer a las familias la posibilidad de elegir para sus hijos una educación similar a la que estaban recibiendo sus hijas mujeres. En las puertas del 25° aniversario, el colegio Holy Cross de mujeres cuenta con 511 alumnas y su 13° promoción de egresadas.